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Moore

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Acesso Inicial

Este manual tem o objetivo de descrever como se deve acessar os Clusters a partir de um acesso externo a rede.

  1. Instalação das Ferramentas Necessárias

    2. Ao acessar um Supercomputador a partir de um ambiente de rede externo, se faz necessário o uso de um VPN (Virtual Private Network) para a conexão a rede interna do computador. A Figura 1.1 ilusta como funciona o processo da utilização do VPN, demonstrando que o objetivo é conectar sua máquina pessoal ao nó mestre para utilização dos serviços do cluster.

    Rede de um Cluster
    Figura 1.1: Exemplo de conexão de um Cluster. Fonte: Computação em grelha e cluster.

    Para a instalação da ferramenta que utilizamos, o Escritório de Segurança da Informação para o Interior - Volta Redonda produziu um material didádico que pode ser requisitado pelo link . A partir desta ponto, você terá acesso a seção de pastas no google drive, onde selecionará qual sistema operacional (Windows, Linux ou Mac) está utilizando e cada um terá um processo diferente de instalação.

Manual Moore

Este manual tem o objetivo de descrever como se deve subter "jobs" ao cluster Moore.

Jobs paralelos (MPI)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar
Jobs paralelos (OpenMP)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar
Jobs paralelos (Hibrido)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar

Manual Murilinho

Jobs paralelos (MPI)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar
Jobs paralelos (OpenMP)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar
Jobs paralelos (Hibrido)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar

Manual Heun

Jobs paralelos (MPI)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar
Jobs paralelos (OpenMP)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar
Jobs paralelos (Hibrido)
#!/bin/bash
#SBATCH --nodes=N                      #Numero de Nós
#SBATCH --ntasks-per-node=TPN          #Numero de tarefas por Nó
#SBATCH --ntasks=T                     #Numero total de tarefas MPI
#SBATCH -p FILA                        #Fila (partition) a ser utilizada
#SBATCH -J JOB			       #Nome job
#SBATCH --exclusive                    #Utilização exclusiva dos nós durante a execução do job

#Exibe os nós alocados para o Job
echo $SLURM_JOB_NODELIST
nodeset -e $SLURM_JOB_NODELIST

cd $SLURM_SUBMIT_DIR
Copiar